128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1130 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 214 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  48.57 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  46.32 
 
 		 264 aa  158  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  48.13 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  44.88 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  38.4 
 
 		 248 aa  141  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  39.61 
 
 		 270 aa  128  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  41.09 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  43.62 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  40.68 
 
 		 191 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  39.5 
 
 		 270 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  39.55 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  38.31 
 
 		 271 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  38.59 
 
 		 257 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  38.86 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  38.89 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  37 
 
 		 280 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  36.2 
 
 		 233 aa  95.1  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  38.74 
 
 		 300 aa  94.7  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  35.54 
 
 		 199 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  35 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  33.67 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  35.39 
 
 		 202 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  33.5 
 
 		 235 aa  85.1  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  33.13 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  32.16 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  31.49 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  32.56 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  33.91 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  30.54 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  30.54 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  32.53 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  31.55 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  29.61 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  31.14 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  31.41 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  31.14 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  31.14 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  29.44 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  31.36 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  31.36 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  31.36 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  29.44 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  27.59 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  28.9 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  26.04 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  28.82 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  28.57 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  29.59 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  30.36 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  30.54 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  28.74 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  28.65 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  23.53 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  28.16 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  26.74 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  30.95 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  29.14 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  29.07 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  28.9 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  28.57 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  26.09 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  28.48 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  23.35 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  28.41 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  27.67 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  28.57 
 
 		 179 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  30.48 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  28.49 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  29.59 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  29.7 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  31.61 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1820  hypothetical protein  30.46 
 
 		 415 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.241651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  40.35 
 
 		 134 aa  51.6  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  24.55 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  27.27 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  28.25 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  25.97 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  21.3 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  27.78 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  26.88 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  27.78 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  26.45 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  26.2 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  26.51 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  27.78 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  38.6 
 
 		 113 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  25.4 
 
 		 370 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  28.34 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  29.14 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  26.23 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  26.23 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  27.17 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  37.29 
 
 		 134 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7907  hypothetical protein  27.54 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  36.36 
 
 		 117 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2814  hypothetical protein  25.3 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  27.49 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  23.86 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>