94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0869 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  37.39 
 
 		 270 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  40 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  42.78 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  38.43 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  38.89 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  37.27 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  37.5 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  37.77 
 
 		 253 aa  95.5  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  36.61 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  35.98 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  31.84 
 
 		 191 aa  86.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  35.87 
 
 		 300 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  37.44 
 
 		 271 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  34.87 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  34.5 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  33.7 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  33 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  32.56 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  38.03 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  31.25 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  32.22 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  34.08 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  28.07 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  33.14 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  32.02 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  28.65 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  29.59 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  29.31 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  30.64 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  30.23 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  28.35 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  32.45 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  30.81 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  34.05 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  34.05 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  29.17 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  30.06 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  30.56 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  29.41 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  33.89 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  30 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  32.97 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  28.81 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  28.42 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  29.1 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  30.68 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  29.38 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  29.14 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  29.38 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  28.19 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  30.81 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  26.9 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  26.9 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  29.07 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  26.9 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  29.21 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  28.3 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  28.3 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  24.29 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  30.16 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  29.55 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  29.05 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  27.84 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  26.26 
 
 		 179 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  27.27 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  29.82 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  27.33 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  26.95 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  26.15 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  26.15 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  29.38 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  28.16 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  28.87 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  29.38 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  29.38 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  27.83 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  27.17 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  24.71 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  27.47 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  40 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  30.11 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3708  hypothetical protein  27.21 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  31.38 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  27.86 
 
 		 207 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  28.98 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  27.21 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  27.21 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  24.73 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  27.33 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  37.18 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  28.99 
 
 		 227 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>