154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4157 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  100 
 
 
217 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  55.43 
 
 
253 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  45.68 
 
 
248 aa  184  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  53.51 
 
 
264 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  49.73 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  43.72 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  43.68 
 
 
191 aa  144  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  49.44 
 
 
231 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  49.13 
 
 
208 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  40.64 
 
 
270 aa  138  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  43.46 
 
 
239 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  45.86 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  42.6 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  40 
 
 
300 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  41.41 
 
 
229 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  42.11 
 
 
270 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  39.71 
 
 
222 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  44.25 
 
 
223 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  39.32 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  42.26 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
280 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  40 
 
 
208 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  38.82 
 
 
202 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  36.18 
 
 
235 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  37.27 
 
 
233 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  38.2 
 
 
199 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  36.26 
 
 
203 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  36.08 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  35.15 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  40.12 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  35.58 
 
 
213 aa  92  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  35.76 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  35.98 
 
 
208 aa  89  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  36.75 
 
 
210 aa  85.5  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  34.27 
 
 
205 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  34.94 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  34.05 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  34.1 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  34.94 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  34.94 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  31.11 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  36.9 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  33.13 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  31.25 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  36.88 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  32.98 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  32.18 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  32.92 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  34.68 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  32.56 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  30.35 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  29.89 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  32.76 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  32.2 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  26.8 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  30.53 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  30.53 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  30.53 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  28.43 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  28.43 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  31.58 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  31.03 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  30.3 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  31.87 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  29.65 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  30.23 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  30.99 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  31.25 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  35.44 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  28.57 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  30.18 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  28.66 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  31.58 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  27.44 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  27.57 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  31.93 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  31.84 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  32.7 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  32.14 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  30.29 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  30.29 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  32.75 
 
 
407 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  27.6 
 
 
237 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  27.6 
 
 
237 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  29.88 
 
 
207 aa  61.6  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  24.71 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  28.33 
 
 
279 aa  58.2  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  29.56 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  29.56 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  29.56 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  27.41 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  30.46 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  27.01 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  36.14 
 
 
139 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  28.49 
 
 
370 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>