173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5320 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  98.68 
 
 
227 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  70.39 
 
 
218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  57.2 
 
 
243 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  57.81 
 
 
237 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  57.81 
 
 
237 aa  223  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  56.12 
 
 
189 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  49.78 
 
 
228 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  49.78 
 
 
228 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  60.44 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  56.52 
 
 
215 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  44.58 
 
 
220 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  56.28 
 
 
227 aa  175  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  53.85 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  51.13 
 
 
229 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  44.8 
 
 
213 aa  164  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  42.79 
 
 
207 aa  162  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  51.09 
 
 
217 aa  154  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  48.86 
 
 
206 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  45 
 
 
209 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  47.16 
 
 
213 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  47.16 
 
 
213 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  47.16 
 
 
213 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  49.23 
 
 
237 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  43.33 
 
 
232 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  38.5 
 
 
203 aa  142  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  41.09 
 
 
199 aa  141  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  51.16 
 
 
217 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  42.16 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  37.04 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  43.89 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  36.79 
 
 
213 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  36.82 
 
 
219 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  37.8 
 
 
197 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  37.8 
 
 
197 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  40.64 
 
 
195 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  38.77 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  36.36 
 
 
197 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  37.37 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  36.36 
 
 
202 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  39.55 
 
 
205 aa  108  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  40.11 
 
 
202 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  40.11 
 
 
202 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  39.55 
 
 
202 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  38.07 
 
 
227 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  31.55 
 
 
188 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  31.55 
 
 
188 aa  99  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  32.73 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  33.7 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  35.85 
 
 
210 aa  96.3  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  34.46 
 
 
207 aa  96.3  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  37.72 
 
 
208 aa  94.7  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3708  hypothetical protein  27.75 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  27.8 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  36.42 
 
 
212 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  32.26 
 
 
223 aa  92.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  31.9 
 
 
207 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
237 aa  91.7  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  34.86 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2814  hypothetical protein  29.19 
 
 
188 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  35.63 
 
 
224 aa  89  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  33.68 
 
 
264 aa  88.6  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  29.61 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  32.83 
 
 
271 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  30.53 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  34.03 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  30.46 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  34.27 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  33.51 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  30.43 
 
 
257 aa  82  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  32.56 
 
 
208 aa  82  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  31.28 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  28.02 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  32.94 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10390  hypothetical protein  25.78 
 
 
356 aa  79  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  28.5 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  34.32 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  31.58 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  36.52 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  29.28 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  30.39 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  31.6 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  31.18 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  30.81 
 
 
191 aa  72  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  29.21 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  32.34 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  31.76 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  30.06 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  27.98 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  28.7 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  29.07 
 
 
246 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23400  hypothetical protein  40.54 
 
 
74 aa  62.8  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549053  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  30.92 
 
 
230 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  27.13 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  27.01 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  29.14 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  34.71 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  29.53 
 
 
233 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  28.32 
 
 
263 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>