169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2214 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  100 
 
 
207 aa  417  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  45.21 
 
 
208 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  48.37 
 
 
202 aa  137  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  41.32 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  40.28 
 
 
203 aa  134  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  45.83 
 
 
202 aa  134  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  43.35 
 
 
265 aa  128  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 
217 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  39.57 
 
 
202 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  39.57 
 
 
202 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  37.8 
 
 
213 aa  121  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  39.57 
 
 
202 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  37.23 
 
 
228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  43.79 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  43.79 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  43.79 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  37.23 
 
 
228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  44.38 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  38.14 
 
 
207 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  37.56 
 
 
213 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  35.45 
 
 
220 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  37.95 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  41.05 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  43.48 
 
 
199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  39.07 
 
 
223 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  35.78 
 
 
229 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  32.39 
 
 
205 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  38.41 
 
 
227 aa  102  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  38.31 
 
 
223 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  41.38 
 
 
212 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  39.53 
 
 
231 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  36.04 
 
 
207 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  35.4 
 
 
232 aa  100  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  36.98 
 
 
227 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  40.31 
 
 
189 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  36.99 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  34.88 
 
 
237 aa  99.4  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  33.84 
 
 
219 aa  99  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  43.15 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  35.22 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  39.49 
 
 
205 aa  95.1  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  26.92 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  36.97 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  37.57 
 
 
227 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  34.62 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  34.62 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  34.62 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  34.57 
 
 
218 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  32.11 
 
 
237 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  32.11 
 
 
237 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  31.12 
 
 
243 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  30.81 
 
 
237 aa  85.5  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  35.53 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  35.53 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  32.63 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  38 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  32.32 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  34.5 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  32.3 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  34.87 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  35.33 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  31.46 
 
 
280 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  33.12 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  31.03 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  27.59 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  27.01 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  31.96 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  33.54 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  28.5 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  31.55 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  31.44 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  31.71 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  32.47 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  29.63 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  32.72 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  30.63 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  25 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  28.57 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  30.29 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  25.64 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  28.06 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  32.41 
 
 
203 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  26.35 
 
 
264 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  31.58 
 
 
222 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3397  hypothetical protein  27.86 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  29.49 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  29.88 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7907  hypothetical protein  30.2 
 
 
202 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  31.28 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  31.28 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  27.68 
 
 
200 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  36.36 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  32.45 
 
 
209 aa  58.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  28.12 
 
 
185 aa  58.2  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  28.57 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  31.33 
 
 
370 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3708  hypothetical protein  30.72 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>