175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2245 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  68.33 
 
 
213 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  54.84 
 
 
189 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  41.63 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  40.64 
 
 
237 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  40.64 
 
 
237 aa  171  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  43.15 
 
 
225 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  43.15 
 
 
225 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  45 
 
 
207 aa  168  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  48.24 
 
 
218 aa  167  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  42.92 
 
 
227 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  43.16 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  43.16 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  51.7 
 
 
215 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  50.87 
 
 
231 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  43.84 
 
 
217 aa  157  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  41.63 
 
 
227 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  49.37 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  49.37 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  49.37 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  40 
 
 
229 aa  151  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  48.45 
 
 
217 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  41.83 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  41.21 
 
 
209 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  47.77 
 
 
203 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  47.09 
 
 
227 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  47.8 
 
 
206 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  44.2 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  44.94 
 
 
232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  45.62 
 
 
227 aa  128  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  44.16 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  44.16 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  43.33 
 
 
213 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  44.05 
 
 
199 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  43.31 
 
 
202 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  41.14 
 
 
195 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  37.61 
 
 
202 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  43.51 
 
 
197 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  38.83 
 
 
202 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  38.83 
 
 
202 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  40.11 
 
 
265 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 
202 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  41.14 
 
 
207 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  41.98 
 
 
205 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  38.38 
 
 
208 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  35.29 
 
 
210 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  46.85 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  37.34 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  35.8 
 
 
197 aa  95.1  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  40.26 
 
 
208 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  35 
 
 
223 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  36.54 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  34.63 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  35.76 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  39.62 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  39.39 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  35.58 
 
 
191 aa  88.2  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  36.94 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2814  hypothetical protein  28.28 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  34.38 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  36.16 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  35.44 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3708  hypothetical protein  31.65 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  31.06 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  31.06 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  32.21 
 
 
270 aa  81.6  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  28.52 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  37.34 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  34.97 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  36.65 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  33.51 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  32.94 
 
 
264 aa  79  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  34.8 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  34.29 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  32.39 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  33.14 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  31.15 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  29.12 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  34.12 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  33.53 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  31.07 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  35.67 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  29.41 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  37.97 
 
 
230 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  31.03 
 
 
253 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  38.12 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  27.14 
 
 
248 aa  71.6  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  27.39 
 
 
179 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  31.09 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  34.38 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  31.58 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  27.85 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  30.69 
 
 
226 aa  64.7  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  31.46 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  27.15 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  30.1 
 
 
271 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  26.85 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>