129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  58.15 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  49.12 
 
 		 217 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  42.91 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  46.32 
 
 		 214 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  39.1 
 
 		 270 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  45.36 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  40.44 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  40.27 
 
 		 217 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  42.31 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  38.35 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  42.11 
 
 		 233 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  40.45 
 
 		 208 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  35.98 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  43.6 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  38.46 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  39.07 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  37.22 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  37.86 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  38.12 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  36.69 
 
 		 199 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  32.98 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  40.57 
 
 		 243 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  35.93 
 
 		 202 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  34.95 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  34.24 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  33.7 
 
 		 219 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  32.07 
 
 		 195 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  33.71 
 
 		 265 aa  88.6  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  32.54 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  32.53 
 
 		 202 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  32.53 
 
 		 202 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  32.53 
 
 		 202 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  35.33 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  30.63 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  33.93 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  30.16 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  34.48 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  34.12 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  33.71 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  32.54 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  30.99 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  30.81 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  31.14 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  32.94 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  32.57 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  29.07 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  32.57 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  29.07 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  31.74 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  32.54 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  35.06 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  29.63 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  31.37 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  30.52 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  28.95 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  28.37 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  30.53 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  28.37 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  29.1 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  34.52 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  30.56 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  31.55 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  32.74 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  32.74 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  32.74 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  34.91 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  30.36 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  30 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  27.98 
 
 		 198 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  32.14 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  29.91 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  29.91 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  32.6 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  26.26 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  28.19 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  30.77 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  28.57 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  31.61 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  26.15 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  29.59 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  27.53 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  27.4 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  26.35 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  27.91 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  27.01 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  26.54 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  29.02 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  25.82 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  27.75 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  26.98 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  28.14 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  31.55 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  22.41 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  25.88 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  26.32 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  27.46 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  27.17 
 
 		 179 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  26.09 
 
 		 179 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  26.17 
 
 		 370 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>