180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4415 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 202 aa  411  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  48.85 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  51.72 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  47.4 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  46.47 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  48.37 
 
 		 207 aa  137  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  45.06 
 
 		 227 aa  131  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  49.11 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  41.92 
 
 		 265 aa  131  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  40.22 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  40.22 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  39.66 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  47.34 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  44.57 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  39.71 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  43.55 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  48.24 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  46.78 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  40.48 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  46.78 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  44.2 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  47.43 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  44.03 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  44.02 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  40 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  41.52 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  41.01 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  46.05 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  42.68 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  37 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  37 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  39.06 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  38.27 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  42.11 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  38.71 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  38.71 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  40.22 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  36.68 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  42.86 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  35.26 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  40.44 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  40.44 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  45.16 
 
 		 213 aa  111  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  45.16 
 
 		 213 aa  111  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  45.16 
 
 		 213 aa  111  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  40.74 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  43.12 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  38.85 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  34.67 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  42.18 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  37.91 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  41.89 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  36.21 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  35.86 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  36 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  35.71 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  39.34 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  39.35 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  36.21 
 
 		 232 aa  85.5  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  29.41 
 
 		 179 aa  85.5  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  35.62 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  36.99 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  31.55 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  30.38 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  28.24 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  35.56 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  34.34 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  36 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  31.63 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  30.32 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  29.33 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  34.67 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  30 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7907  hypothetical protein  31.17 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  34.59 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3397  hypothetical protein  31.01 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  31.76 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  31.54 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  32.16 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  32.47 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  32.7 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  32.64 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  28.25 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  29.05 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  29.38 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  30.56 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  30.95 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  32.47 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  30.14 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  27.37 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  25.94 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  28.57 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  28.57 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  28.4 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  31.55 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10390  hypothetical protein  26.07 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206223  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  29.75 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  29.74 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>