157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0315 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  41.59 
 
 
207 aa  141  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  42.56 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  46.52 
 
 
199 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  47.47 
 
 
202 aa  135  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  42.6 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  42.6 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  42.6 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  40.3 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  42.92 
 
 
213 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  41.53 
 
 
195 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  35.71 
 
 
243 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  43.33 
 
 
220 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  41.35 
 
 
203 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  45.57 
 
 
209 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  34.48 
 
 
237 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  34.48 
 
 
237 aa  118  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  46.99 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  39.18 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  44 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  44.23 
 
 
202 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  47.13 
 
 
202 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  47.13 
 
 
202 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  44.38 
 
 
217 aa  114  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  43.26 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  39.68 
 
 
237 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  43.95 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  40.51 
 
 
207 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  45.28 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  37.61 
 
 
232 aa  111  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  42.77 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  42.77 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  44.94 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  45.09 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  44.32 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  44.72 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  36.79 
 
 
225 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  36.79 
 
 
225 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  44.77 
 
 
227 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  36.51 
 
 
205 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  43.29 
 
 
218 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  40.25 
 
 
206 aa  104  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  35.98 
 
 
227 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  37.44 
 
 
197 aa  101  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  36.98 
 
 
197 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  36.98 
 
 
197 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  38.89 
 
 
227 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  38.22 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  35.94 
 
 
207 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  38.46 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  36.98 
 
 
197 aa  92  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  36.36 
 
 
208 aa  92  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  35.58 
 
 
217 aa  92  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  38.22 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  38.61 
 
 
208 aa  89  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  41.57 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  37.27 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  35.59 
 
 
232 aa  84  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  30.39 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  34.43 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  31.13 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  33.95 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  33.93 
 
 
264 aa  74.7  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  28.88 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  28.88 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  28.22 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  31.28 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  32.09 
 
 
253 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  30.59 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  30.54 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  32.05 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  35.22 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  28.95 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  32.9 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  30.41 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  29.59 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  30.77 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  33.13 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  35.62 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3708  hypothetical protein  27.23 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  28.95 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  30.81 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  31.84 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  32.72 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  29.22 
 
 
300 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  27.55 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  31.52 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7907  hypothetical protein  32.73 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  31.33 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  32.29 
 
 
270 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  29.68 
 
 
211 aa  61.6  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  29.48 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  31.33 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  25.5 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  31.33 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  29.68 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  28.95 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  30.72 
 
 
250 aa  58.5  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>