175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0590 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  407  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  50.83 
 
 
191 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  54.17 
 
 
223 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  45.59 
 
 
217 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  49.24 
 
 
239 aa  165  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  52.2 
 
 
199 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  46.41 
 
 
257 aa  151  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  42.4 
 
 
300 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  45.45 
 
 
217 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  45.31 
 
 
229 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  46.55 
 
 
231 aa  141  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  46.91 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  41.54 
 
 
280 aa  136  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  42.08 
 
 
253 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  45.18 
 
 
221 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  47.62 
 
 
243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  36.86 
 
 
248 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  40.45 
 
 
264 aa  121  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  39 
 
 
271 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  35.65 
 
 
270 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  42.11 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  35.47 
 
 
270 aa  111  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  38.18 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  38.86 
 
 
214 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  43.83 
 
 
217 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  40.91 
 
 
202 aa  101  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  42.5 
 
 
217 aa  99.4  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  37.25 
 
 
202 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  37.25 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  39.74 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  37.25 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  42.28 
 
 
207 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  36.18 
 
 
195 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  42.04 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  38.41 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  40.26 
 
 
220 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  40.88 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  37.43 
 
 
218 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  36.78 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  39.62 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  37.34 
 
 
226 aa  91.3  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  33.16 
 
 
235 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  35.2 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  36.72 
 
 
228 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  36.72 
 
 
228 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  36.18 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  36.18 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  36.97 
 
 
189 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  34.29 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  39.87 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  32.86 
 
 
233 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  35.95 
 
 
209 aa  85.9  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  38.56 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  35.5 
 
 
225 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  35.5 
 
 
225 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  35.5 
 
 
227 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  35.8 
 
 
227 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  34.86 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  35.96 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  36.99 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  35.62 
 
 
224 aa  81.3  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  38.56 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  37.75 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  37.75 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  37.75 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  34.68 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  37.58 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  32.68 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  35.67 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  36.77 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  31.05 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  37.67 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  32.58 
 
 
237 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  35.26 
 
 
232 aa  78.2  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  35.71 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  30.25 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  34.42 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  30.94 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  39.87 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  30.81 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  33.55 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  41.43 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  33.12 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  34.21 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  28.65 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  30.41 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  32.24 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  32.88 
 
 
208 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  30.43 
 
 
237 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  30.43 
 
 
237 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  35.44 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  35.9 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  32.21 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  36.81 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1820  hypothetical protein  39.75 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.241651 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  29.27 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  33.11 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  27.74 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  29.88 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  27.11 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>