177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5740 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  401  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  54.01 
 
 
208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  47.09 
 
 
207 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  45.59 
 
 
219 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  52 
 
 
202 aa  158  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  52.03 
 
 
195 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  42.47 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  47.55 
 
 
210 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  50.98 
 
 
213 aa  148  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  50.98 
 
 
213 aa  148  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  50.98 
 
 
213 aa  148  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  56.67 
 
 
202 aa  148  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  40.66 
 
 
243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  46.43 
 
 
203 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  50.66 
 
 
206 aa  145  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  45.9 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  39.57 
 
 
237 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  39.57 
 
 
237 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  46.19 
 
 
213 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  50.64 
 
 
209 aa  141  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  42.22 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  39.19 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  42.22 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  39.19 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  45.71 
 
 
227 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  45.36 
 
 
205 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  44.33 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  42.92 
 
 
229 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  47.4 
 
 
232 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  44.68 
 
 
237 aa  135  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  48.55 
 
 
215 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  42.71 
 
 
218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  47.98 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  39.29 
 
 
227 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  47.88 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  46.51 
 
 
227 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  43.46 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  40.09 
 
 
220 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  41.75 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  41.75 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  43.71 
 
 
223 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  43.9 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  42.67 
 
 
202 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  42.67 
 
 
202 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  38.83 
 
 
213 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  42 
 
 
202 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  42.38 
 
 
223 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  41.24 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  44.38 
 
 
227 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  44 
 
 
207 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  35.12 
 
 
207 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  38.2 
 
 
217 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  37.5 
 
 
205 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  35.27 
 
 
197 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  41.38 
 
 
212 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  31.98 
 
 
207 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  36.42 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  31.69 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  33.54 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  31.69 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  31.65 
 
 
237 aa  88.2  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  35.26 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  31.16 
 
 
264 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  38.56 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7907  hypothetical protein  32.74 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  35 
 
 
253 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  34.63 
 
 
235 aa  84.7  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  28.71 
 
 
224 aa  84.7  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  35.23 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  32.28 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  32.11 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  31.37 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  33.96 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  37.58 
 
 
230 aa  77.8  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  31.72 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  31.68 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  34.3 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  35.57 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  31.84 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  32.69 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  31.21 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  29.95 
 
 
270 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  31.14 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  30.49 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  28 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  29.32 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  29.32 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3397  hypothetical protein  32.41 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  30.43 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  31.17 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  29.39 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3708  hypothetical protein  27.94 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23400  hypothetical protein  48.61 
 
 
74 aa  68.9  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549053  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  32.03 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  30.65 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  29.44 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  26.27 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  29.63 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1633  hypothetical protein  30.32 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>