38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1633 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1633  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1648  hypothetical protein  85.26 
 
 
191 aa  286  9e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174345  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  36.53 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  35.93 
 
 
179 aa  87.8  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  35.06 
 
 
202 aa  87  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  32.97 
 
 
208 aa  85.1  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  31.25 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  29.41 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  29.25 
 
 
223 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  24.59 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  29.58 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  27.69 
 
 
207 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  26.67 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  26.7 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  26.72 
 
 
223 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  27.01 
 
 
209 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  29.66 
 
 
208 aa  52  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  29.61 
 
 
227 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1484  hypothetical protein  55.74 
 
 
78 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000133691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  24.61 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  24.22 
 
 
210 aa  48.5  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  26.53 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  23.32 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  20.38 
 
 
265 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  26.11 
 
 
217 aa  47.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  24.22 
 
 
191 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  26.62 
 
 
257 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  25.86 
 
 
253 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  26.49 
 
 
206 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  28.26 
 
 
202 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7907  hypothetical protein  30.43 
 
 
202 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  24.55 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  26.09 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  26.09 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  24.26 
 
 
203 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  23.68 
 
 
217 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>