117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5333 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 206 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  44.32 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  43.78 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7907  hypothetical protein  48.7 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  33.69 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  33.69 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  39.33 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  35.48 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  33.51 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  33.51 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  28.91 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  32.5 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  31.71 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  32 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  33.73 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  35.37 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  30.92 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  30.32 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  26.19 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  33.72 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  31.08 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  30.17 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  28.36 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  25.48 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  33.12 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  29.73 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  32.3 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  31.74 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  31.58 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  30.38 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  30.38 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  30.38 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  24.64 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  29.44 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  30.13 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  29.82 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  29.88 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  24.23 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  24.23 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  26 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  29.95 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  28.72 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  28.72 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  28.07 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  30.49 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  25.75 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  25.98 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  27.35 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  25.9 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  27.35 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  28.72 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  26.67 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  28.5 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  24.32 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  25.91 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  24.31 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  23.36 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  23.41 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  25.82 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  26.97 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  28.17 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  24.58 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  23.91 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  28.57 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  24.89 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  24.76 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  27.14 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  25.62 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  24.39 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  24.5 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  25.49 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  25.86 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  25.16 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  28.18 
 
 		 134 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  25.66 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  23.11 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  24.28 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  24.5 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  23.53 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  23.76 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  21.39 
 
 		 270 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  23.9 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  20.3 
 
 		 271 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  22.01 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  22.97 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  26.82 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  23.49 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  24.49 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  21.23 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  25.31 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  25.9 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3397  hypothetical protein  25.32 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  22.15 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  27.66 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  26.09 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1633  hypothetical protein  26.49 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>