49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3397 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3397  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  387  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  33.87 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  37.01 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  38.97 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  31.51 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  31.76 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  30.14 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  29.93 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  29.45 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  26.57 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  29.45 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  28.64 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  33.58 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  29.5 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  27.86 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  27.86 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  26.42 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  30.77 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  23.6 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  31.51 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  24.41 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  28.77 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  26.34 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  31.39 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  25.17 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  25.17 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  25.17 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  23.93 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  28.97 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  27.74 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  27.74 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  25.88 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  25.17 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  29.29 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  24.84 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  30.57 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  24.7 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  28.48 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  25 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  26.04 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  23.86 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  27.91 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  24.52 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  25 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  25.57 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  24.12 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  22.91 
 
 		 228 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  22.91 
 
 		 228 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  27.22 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>