184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3980 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  58.02 
 
 
213 aa  215  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  58.02 
 
 
213 aa  215  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  58.02 
 
 
213 aa  215  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  63.21 
 
 
209 aa  208  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  56.68 
 
 
206 aa  193  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  42.5 
 
 
237 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  42.5 
 
 
237 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  45 
 
 
220 aa  168  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  47.37 
 
 
203 aa  167  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  41.7 
 
 
243 aa  167  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  50.28 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  52.6 
 
 
228 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  52.6 
 
 
228 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  45.98 
 
 
229 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  44.13 
 
 
213 aa  162  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  49.22 
 
 
217 aa  161  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  52.6 
 
 
215 aa  161  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  50.29 
 
 
231 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  50.29 
 
 
218 aa  158  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  40.87 
 
 
232 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  52.2 
 
 
227 aa  156  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  41.44 
 
 
225 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  41.44 
 
 
225 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  50 
 
 
189 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  41.07 
 
 
227 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  54.78 
 
 
217 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  48.66 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  48.84 
 
 
227 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  40.7 
 
 
208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  41.59 
 
 
213 aa  141  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  44.69 
 
 
237 aa  141  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  41.75 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  46.36 
 
 
202 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  45.7 
 
 
202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  45.7 
 
 
202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  46.31 
 
 
202 aa  134  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  45.62 
 
 
205 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  42.77 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  42.77 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  41.29 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  44.74 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  37.63 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  39.53 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  38.46 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  38.94 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  42.17 
 
 
197 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  39.67 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  40.27 
 
 
207 aa  105  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  39.47 
 
 
212 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  45.32 
 
 
227 aa  99  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  33.01 
 
 
197 aa  97.8  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  32.02 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  39.74 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  32.18 
 
 
237 aa  94.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  32.6 
 
 
208 aa  94.7  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  32.34 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  36 
 
 
223 aa  94.7  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  35.23 
 
 
188 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  35.15 
 
 
191 aa  89  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  35.12 
 
 
223 aa  88.2  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23400  hypothetical protein  54.17 
 
 
74 aa  85.5  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549053  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  35.03 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  31.1 
 
 
198 aa  84.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  28.71 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  28.71 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3708  hypothetical protein  29.33 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  33.54 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  31.34 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  32.04 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  31.03 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  31.92 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  33.9 
 
 
239 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2814  hypothetical protein  28.22 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  37.18 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  34.15 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  30.15 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  33.14 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  35.37 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  31.69 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  36.65 
 
 
243 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  29.3 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  32 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  25.53 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  34.18 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  35 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  28.45 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  26.06 
 
 
179 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  30.54 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  30 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  30.1 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  35.67 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  30.91 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  30.3 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  32.29 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  33.16 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  31.58 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10390  hypothetical protein  27.43 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  30.91 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  28.9 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>