114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2558 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  58.33 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  53.25 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  50.57 
 
 
208 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  47.09 
 
 
191 aa  164  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  47.34 
 
 
280 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  42.42 
 
 
229 aa  148  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  43.72 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  43.48 
 
 
264 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  42.16 
 
 
231 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  43.4 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  41.42 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  40.96 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  42.25 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  36.02 
 
 
248 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  43.63 
 
 
243 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  43.58 
 
 
214 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  39.36 
 
 
257 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  40.11 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  38.89 
 
 
233 aa  111  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  35.9 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  34.5 
 
 
270 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  36.23 
 
 
270 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  35.96 
 
 
271 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  34.32 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  37.43 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  33.53 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  33.53 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  37.18 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  34.12 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  37.97 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  29.87 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  33.14 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  35.36 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  30.32 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  31.33 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  30.59 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  30.48 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  30.77 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  33.53 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  33.53 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  34.19 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  32.11 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  30.77 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  34.34 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  28.92 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  28.8 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  32.69 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  31.36 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  31.21 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  31.21 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  31.21 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  30.92 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  31.61 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  28.82 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  30.05 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  28.82 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  31.33 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  30.95 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  30.05 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  28.57 
 
 
223 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  29.5 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  29.03 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  30.63 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  29.06 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  26.49 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  32.08 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  27.68 
 
 
232 aa  59.3  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  28.82 
 
 
227 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  27.33 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  31.74 
 
 
227 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  28.73 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  30.91 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  30.12 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  30 
 
 
237 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  29.03 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  31.9 
 
 
232 aa  55.5  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  24.55 
 
 
207 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  30.25 
 
 
207 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  28.3 
 
 
407 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  25.32 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  25.32 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1820  hypothetical protein  31.68 
 
 
415 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.241651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  25.95 
 
 
370 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  27.63 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  31.76 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  33.98 
 
 
113 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  25.31 
 
 
209 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  24.53 
 
 
223 aa  48.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  26.11 
 
 
279 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  26.75 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  23.08 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  27.1 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  25.85 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  27.27 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  25 
 
 
239 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  24.05 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  35.23 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>