201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1535 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  228  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  56.2 
 
 
134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  65.59 
 
 
117 aa  124  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  54.4 
 
 
134 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  46.49 
 
 
128 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  45.83 
 
 
134 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  52.08 
 
 
122 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  49.21 
 
 
134 aa  104  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  49.57 
 
 
119 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  55.17 
 
 
126 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  49.15 
 
 
119 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  46.43 
 
 
128 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  55.1 
 
 
139 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  52.38 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  43.09 
 
 
131 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  42.28 
 
 
137 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  42.72 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  44.44 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  54.32 
 
 
130 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  43.93 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  38.46 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  42.02 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  48.15 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  43.36 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  48.28 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  48.28 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  48.19 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  51.85 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  45.45 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  47.13 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  47.13 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  46.99 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  40.37 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  47.44 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.44 
 
 
517 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  38.74 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  41.49 
 
 
263 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  38.94 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  37.61 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  40.26 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  43.02 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  39.13 
 
 
223 aa  67.8  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  42.5 
 
 
250 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  36.11 
 
 
192 aa  67  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  43.42 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  46.97 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  45.12 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  45.45 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  38.78 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  48.48 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  35.71 
 
 
209 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  56.6 
 
 
202 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  35.51 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  53.85 
 
 
224 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  34.74 
 
 
100 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  52.54 
 
 
208 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  47.06 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  47.06 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  50 
 
 
226 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  42.42 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  34.48 
 
 
207 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  39.34 
 
 
217 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  51.79 
 
 
202 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  43.1 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  35.58 
 
 
211 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  52.73 
 
 
230 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  41.67 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  40.58 
 
 
197 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  45 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  48.33 
 
 
220 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  35.85 
 
 
208 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  50.85 
 
 
205 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  38.04 
 
 
188 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  35.78 
 
 
265 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  42.03 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  49.09 
 
 
219 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  43.48 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  35.09 
 
 
213 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  48.33 
 
 
231 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  47.54 
 
 
215 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  41.3 
 
 
192 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  38.1 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  38.1 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  42.62 
 
 
243 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  51.85 
 
 
208 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  38.89 
 
 
210 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  51.79 
 
 
195 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  43.33 
 
 
206 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  52 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  47.54 
 
 
161 aa  53.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  43.1 
 
 
218 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  46.67 
 
 
228 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  50.94 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  46.67 
 
 
228 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  45 
 
 
189 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  44.26 
 
 
229 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  50.91 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  43.42 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  30.23 
 
 
205 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>