144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0261 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  254  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  254  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  66.29 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  52.99 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  55 
 
 
151 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  50.41 
 
 
158 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  50.41 
 
 
158 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  63.1 
 
 
150 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  61.18 
 
 
152 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  45.16 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  42.86 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  44.35 
 
 
119 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  55.71 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  56.41 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  51.43 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  57.63 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  55.71 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  56.06 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  55.71 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  57.63 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  46.67 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  46.67 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  45.12 
 
 
250 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  51.43 
 
 
127 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  51.43 
 
 
127 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  43.1 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  40.52 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  39.81 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  47.3 
 
 
279 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  50.7 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  51.39 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  41.84 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  45.05 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  37.9 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  52.86 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  33.87 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  45.83 
 
 
246 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  47.3 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  45.33 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  43.53 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  48.53 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  48.53 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  43.21 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  35.87 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.68 
 
 
517 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  40.54 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  35.38 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  46.58 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  36.56 
 
 
194 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  44.05 
 
 
230 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  36.97 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  33.7 
 
 
217 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  36.25 
 
 
207 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  49.32 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  42.11 
 
 
209 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  37.5 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  35.29 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  50 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  40.86 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  50 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  41.07 
 
 
197 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  49.06 
 
 
207 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  31.82 
 
 
134 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  38.46 
 
 
236 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
143 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  48.15 
 
 
192 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  38.46 
 
 
234 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  42.62 
 
 
211 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  42.11 
 
 
192 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  43.86 
 
 
142 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  39.19 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  34.41 
 
 
203 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  35.37 
 
 
160 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  36.99 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  42.59 
 
 
265 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  43.64 
 
 
219 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  31.63 
 
 
239 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  47.06 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  50.94 
 
 
202 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  39.24 
 
 
208 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6516  protein of unknown function DUF305  32.26 
 
 
218 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14254  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  47.17 
 
 
220 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  36.76 
 
 
218 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  43.64 
 
 
237 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  46.3 
 
 
208 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  39.73 
 
 
206 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 
237 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  43.08 
 
 
198 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  38.89 
 
 
300 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  28.92 
 
 
237 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  39.62 
 
 
207 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  38.24 
 
 
195 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  27.96 
 
 
264 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  42.31 
 
 
208 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>