165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4129 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 125 aa  250  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  76.74 
 
 		 133 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  62.16 
 
 		 148 aa  157  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  75.53 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  65.96 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  43.85 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  43.59 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  44.83 
 
 		 128 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  45.3 
 
 		 128 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  55 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  42.4 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  41.67 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  47.78 
 
 		 119 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  53.75 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  49.41 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  43.36 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  40.65 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  35.88 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  43.9 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  43.16 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  47.83 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  47.83 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  38.71 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  46.32 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  49.4 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  50.6 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  50.6 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  50.6 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  45.26 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  42.57 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  41.58 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  45.12 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  44.68 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.05 
 
 		 517 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  38.6 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  45.16 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  47.06 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  48.28 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  41.67 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  36.61 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  44.12 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  46.67 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  38.82 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  44.07 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  51.85 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  45.59 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  47.27 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  46.3 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  47.83 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2316  hypothetical protein  36.43 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.865879 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  40.51 
 
 		 279 aa  57  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  43.1 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  40.54 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  34.07 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  48.21 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  45.9 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  45.9 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  39.71 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  37.14 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  39.71 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  39.71 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  48.53 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  42.42 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  38.18 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  34.88 
 
 		 263 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  46.3 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  32.74 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  48.15 
 
 		 226 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  37.5 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  43.14 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  43.14 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  35.48 
 
 		 237 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  45.28 
 
 		 219 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  41.07 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  31.03 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  46.55 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  39.34 
 
 		 271 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  45.28 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  41.82 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  35.38 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  40.62 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  36.56 
 
 		 227 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  43.64 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  44.64 
 
 		 227 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  32.14 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  47.17 
 
 		 202 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 		 208 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  41.18 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  44 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  31.91 
 
 		 232 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  40.98 
 
 		 257 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>