137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6259 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  332  9e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  61.07 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  62.22 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  62.22 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  62.71 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  60.22 
 
 		 127 aa  111  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  60.22 
 
 		 127 aa  111  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  57.89 
 
 		 132 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  50.46 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  44.87 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  43.59 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  59.38 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  53.12 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  52.86 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  53.12 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  59.38 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  59.38 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  59.38 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  57.81 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  57.81 
 
 		 130 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  57.81 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  57.81 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  46.59 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  55.56 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  47.14 
 
 		 119 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  45.12 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  39.33 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  42.11 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  38.46 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  44.29 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  40.66 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  39.33 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  40.82 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  37.7 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  42.7 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  34.92 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  36.21 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  38.67 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  36.26 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  37.5 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  39.29 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  53.7 
 
 		 98 aa  62  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  41.56 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  42.42 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  40.98 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  51.85 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  33.05 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  40.98 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  41.33 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  54.55 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  38.36 
 
 		 279 aa  58.2  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  40.28 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  40.35 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  39.39 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  44.64 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  43.75 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  43.1 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  39.71 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  38.24 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  47.06 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  28.33 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.42 
 
 		 517 aa  54.3  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  40.91 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  42.11 
 
 		 207 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  37.88 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  30.83 
 
 		 237 aa  51.2  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  44.26 
 
 		 192 aa  51.2  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  45.1 
 
 		 224 aa  50.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  40.3 
 
 		 211 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  44.64 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6516  protein of unknown function DUF305  32.79 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  42.59 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  32.95 
 
 		 239 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  43.75 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  35.35 
 
 		 265 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  38.33 
 
 		 218 aa  48.9  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  35.19 
 
 		 197 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  43.4 
 
 		 213 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  39.29 
 
 		 219 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  31.3 
 
 		 210 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2645  hypothetical protein  36.26 
 
 		 207 aa  47.4  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  42.19 
 
 		 198 aa  47.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  43.64 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  44.44 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  38.18 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  42.37 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  38.18 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  41.82 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  38.18 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  36.76 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  38.18 
 
 		 237 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  35.82 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>