182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2045 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  274  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  60.61 
 
 
131 aa  166  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  63.04 
 
 
137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  62.88 
 
 
131 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  65.22 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  64.84 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  69.51 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  67.86 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  63.33 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  63.33 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  59.57 
 
 
141 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  59.57 
 
 
141 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  59.57 
 
 
141 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  54.46 
 
 
122 aa  97.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  43.61 
 
 
134 aa  95.9  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  43.93 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  52.63 
 
 
119 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  53.68 
 
 
119 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  44.78 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  53.01 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  42.62 
 
 
128 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  48.94 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  42.97 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  45.6 
 
 
125 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  38.51 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  51.69 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  47.31 
 
 
128 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  53.66 
 
 
135 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  51.22 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  46.88 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  42.27 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  44.71 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  44.71 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  45.05 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  45.35 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  46.25 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  35.51 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  50 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  54.39 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  52.31 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  52.31 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  56.9 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  53.73 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  55.74 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.67 
 
 
517 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  52.24 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  51.43 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  52.73 
 
 
279 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  45.45 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  55.17 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  53.7 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  48.05 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  53.45 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  47.89 
 
 
246 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  47.22 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  42.65 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  37.78 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  50.91 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  49.06 
 
 
224 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  48.21 
 
 
209 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  49.3 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  43.08 
 
 
218 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  51.67 
 
 
202 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  34.65 
 
 
226 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  55.17 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  39.6 
 
 
237 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  38.89 
 
 
211 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  48.33 
 
 
207 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  55.77 
 
 
230 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  47.46 
 
 
208 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  34.4 
 
 
237 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  37.62 
 
 
217 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  35.79 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  38.04 
 
 
265 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  31.71 
 
 
194 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  35.66 
 
 
206 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  37.68 
 
 
197 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  37.62 
 
 
217 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  44.26 
 
 
208 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  49.15 
 
 
237 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  49.15 
 
 
243 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  49.15 
 
 
237 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2316  hypothetical protein  32.26 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.865879 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  42.25 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  41.51 
 
 
210 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  52.73 
 
 
231 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
197 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  48.21 
 
 
206 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  43.21 
 
 
213 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  38.3 
 
 
189 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  50 
 
 
215 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  48.33 
 
 
229 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  51.85 
 
 
218 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  46.67 
 
 
220 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  44.44 
 
 
198 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  48.08 
 
 
202 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  40.58 
 
 
208 aa  52  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  35.11 
 
 
205 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>