83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0071 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  278  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  46.25 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  37.84 
 
 
120 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  48.05 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  42.35 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  38.71 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  32.77 
 
 
279 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  31.58 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  43.02 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  38.2 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  31.97 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  37.63 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  40.79 
 
 
246 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  41.76 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  37.8 
 
 
250 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  41.56 
 
 
263 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  41.3 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  37.93 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2575  hypothetical protein  48.65 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0843755  normal  0.521427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1027  protein of unknown function DUF305  48.65 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  41.67 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  40.96 
 
 
119 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  34.52 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  34.52 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  38.95 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  41.56 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  41.46 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  38.75 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.95 
 
 
517 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  32.05 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  32.47 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  32.47 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  32.47 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  47.17 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  35.11 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  44.44 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  27.42 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  36.99 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  36.99 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2316  hypothetical protein  43.4 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.865879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  28.69 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  34.69 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  43.1 
 
 
192 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  45.65 
 
 
135 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  25.98 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  33.8 
 
 
211 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  36.36 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  41.18 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  30.23 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  41.18 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  27.62 
 
 
207 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  31.18 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  40.38 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  26.98 
 
 
213 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  31.13 
 
 
194 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  40.35 
 
 
209 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  31.82 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  29.57 
 
 
213 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  36.51 
 
 
164 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  29.23 
 
 
300 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  32.73 
 
 
205 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  39.13 
 
 
235 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2281  protein of unknown function DUF305  32.35 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0018571  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  36.92 
 
 
206 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  36.36 
 
 
206 aa  41.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  29.73 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  32 
 
 
223 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  26.76 
 
 
208 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  36.96 
 
 
210 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  32.31 
 
 
202 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  40 
 
 
198 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  45.24 
 
 
237 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  41.94 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  31.58 
 
 
208 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  30.23 
 
 
197 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  25.76 
 
 
218 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>