155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3396 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  100 
 
 
237 aa  473  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  46.31 
 
 
208 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  41.46 
 
 
212 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  36.73 
 
 
223 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  37.61 
 
 
223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  34.89 
 
 
203 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  35.27 
 
 
207 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  32.57 
 
 
232 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  38.31 
 
 
208 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  36.87 
 
 
227 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  34.2 
 
 
202 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  37.71 
 
 
195 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  32.17 
 
 
208 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  34.66 
 
 
206 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  34.29 
 
 
265 aa  98.2  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  34.69 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  30.93 
 
 
207 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  36.93 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  34.74 
 
 
228 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  34.74 
 
 
228 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  33.51 
 
 
217 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  34.39 
 
 
237 aa  92.4  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  34.54 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  35.8 
 
 
202 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  33.52 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  35.8 
 
 
202 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  32.39 
 
 
209 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  35.8 
 
 
202 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  32.58 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  31.46 
 
 
199 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  31.43 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  31.43 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  31.43 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  34.64 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  33.01 
 
 
210 aa  85.9  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  38.71 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  31.15 
 
 
227 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  30.38 
 
 
225 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  30.38 
 
 
225 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  31.61 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  29.95 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  27.19 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  36.16 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  32.65 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  26.58 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  31.98 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  30.1 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  31.91 
 
 
213 aa  82  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  33.71 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  28.87 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  31.32 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  32.58 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  28.88 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  28.51 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  28.94 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  28.51 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  28.88 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  30.72 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  32.92 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  34.29 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  32.16 
 
 
179 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  29.21 
 
 
221 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  33.54 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  26.34 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  33.13 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  31.98 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  32.95 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  30.81 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  30.72 
 
 
257 aa  72  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  31.33 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  30.73 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  28.45 
 
 
197 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  30.57 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  29.61 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  28.57 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  30.73 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  30.81 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  27.01 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  27.68 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  30.91 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  30.19 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  29.14 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  26.49 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  29.48 
 
 
198 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  24.44 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  29.61 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  24.12 
 
 
211 aa  58.5  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  26.01 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  27.43 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  26.32 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  29.14 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  28.74 
 
 
407 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  28.98 
 
 
230 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  23.86 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  25.37 
 
 
200 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  38.16 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  24.17 
 
 
188 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  29.03 
 
 
370 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  24.28 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>