131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2457 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  95.53 
 
 		 179 aa  354  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7907  hypothetical protein  45.45 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  36.52 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  33.91 
 
 		 265 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  37.1 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  33.51 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  33.14 
 
 		 195 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  32.22 
 
 		 199 aa  95.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  30.98 
 
 		 205 aa  94.4  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  29.21 
 
 		 219 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  35.37 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1633  hypothetical protein  36.36 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  31.69 
 
 		 237 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  29.79 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1648  hypothetical protein  35.59 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174345  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  29.53 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  31.52 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  28.57 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  31.58 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  27.27 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  30.17 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  27.27 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  32.93 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  32.16 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  29.01 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  29.89 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  30.07 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  25.53 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  30.56 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  30.82 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  30.82 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  29.87 
 
 		 231 aa  72  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  27.41 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  27.41 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  27.41 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  25.26 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  27.22 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  29.34 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  29.34 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  30.73 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  28.95 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  29.52 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  34.13 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  27.62 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  28.65 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  32.12 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  27.89 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  27.39 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  27.75 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  29.34 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  29.03 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  28.49 
 
 		 257 aa  67  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  27.43 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  29.71 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  25 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  27.03 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  27.32 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  27.84 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  27.84 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  24.86 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  27.33 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  26.2 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  24.19 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  27.01 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  28.29 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  24.43 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  27.61 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  28.85 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  24.16 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  25.13 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  25.41 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  25.29 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  25.44 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  24.55 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  25.83 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  23.57 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  23.81 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  23.81 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  29.66 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  23.53 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  26.38 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  23.44 
 
 		 226 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  28.29 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  25.28 
 
 		 280 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  24.29 
 
 		 233 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  26.8 
 
 		 239 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3397  hypothetical protein  28.77 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  26.9 
 
 		 407 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  24.54 
 
 		 217 aa  52.4  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  24 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  26.88 
 
 		 241 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  21.32 
 
 		 197 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  21.78 
 
 		 235 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  26.09 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  26.09 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  22.45 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  20.86 
 
 		 270 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>