37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1648 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1648  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  374  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174345  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1633  hypothetical protein  85.26 
 
 		 191 aa  286  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  35.75 
 
 		 179 aa  85.1  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  35.2 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  33.12 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  30.19 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  28.48 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  30.82 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  27.04 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  27.04 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  28.49 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  27.39 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  28.57 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  30.77 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  29.63 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  23.75 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  24.15 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  21.86 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  26.11 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  25 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  25.74 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  28.29 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  27.11 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  24.73 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  26.52 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  28.66 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  25.18 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  25 
 
 		 202 aa  44.7  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1484  hypothetical protein  49.18 
 
 		 78 aa  44.7  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  23.12 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  25.9 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  26.09 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  25.9 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  21.52 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  20.51 
 
 		 265 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>