167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0639 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  100 
 
 
191 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  47.09 
 
 
217 aa  177  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  63.58 
 
 
243 aa  177  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  51.93 
 
 
208 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  50 
 
 
239 aa  174  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  52 
 
 
223 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  45.95 
 
 
264 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  47.62 
 
 
280 aa  156  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  45.3 
 
 
257 aa  156  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  48.15 
 
 
229 aa  154  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  39.81 
 
 
248 aa  153  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  47.09 
 
 
231 aa  150  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  44.04 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  45.4 
 
 
221 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  43.18 
 
 
199 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  45.24 
 
 
222 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  41.49 
 
 
253 aa  134  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  40 
 
 
270 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  39.81 
 
 
271 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  41.24 
 
 
214 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  36.36 
 
 
270 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  38.1 
 
 
300 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  35.14 
 
 
235 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  40 
 
 
213 aa  101  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  36.26 
 
 
202 aa  101  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  35.4 
 
 
208 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  36.97 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  33.53 
 
 
265 aa  95.5  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  37.42 
 
 
220 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
233 aa  93.2  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  36.65 
 
 
213 aa  92.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  36.25 
 
 
202 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  35.71 
 
 
217 aa  92  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  36.25 
 
 
202 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  36.25 
 
 
202 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  37.04 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  35.15 
 
 
217 aa  88.2  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  32.2 
 
 
231 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  34.97 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  34.16 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  34.16 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  35.5 
 
 
218 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  29.32 
 
 
243 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  32.75 
 
 
229 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  32.95 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  35.19 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  36.36 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  29.44 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  32.52 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  34.76 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  32.5 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  32.95 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  30.17 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  33.9 
 
 
237 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  32.72 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  34.34 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  32.16 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  32.16 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  32.32 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  29.45 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  33.13 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  31.21 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  32.32 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  32.32 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  32.32 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  33.13 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  30.39 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  34.55 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  28.65 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  28.65 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  34.78 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  31.71 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  29.45 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  30.67 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  31.07 
 
 
227 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  32.94 
 
 
279 aa  71.6  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  31.79 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  31.79 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  31.79 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  30.06 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  26.38 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  35.53 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  28.4 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  32.32 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  28.49 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  32.92 
 
 
407 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1820  hypothetical protein  30.86 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.241651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  27.65 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  32.75 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  31.25 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3708  hypothetical protein  29.09 
 
 
212 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  24.07 
 
 
207 aa  61.2  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  25.77 
 
 
206 aa  61.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  29.09 
 
 
188 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  29.09 
 
 
188 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  30.86 
 
 
246 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  27.61 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  27.47 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  28.74 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  27.61 
 
 
179 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>