157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1237 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  58.33 
 
 
217 aa  247  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  46.67 
 
 
280 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  50 
 
 
191 aa  175  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  53.07 
 
 
223 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  44.8 
 
 
229 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  51.61 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  44.26 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  49.45 
 
 
231 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
248 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  45.11 
 
 
253 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  44.55 
 
 
217 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  44.12 
 
 
222 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  42.13 
 
 
199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  45.63 
 
 
243 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  45.03 
 
 
214 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  41.76 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  41.05 
 
 
300 aa  125  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  42.54 
 
 
257 aa  124  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  36.8 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  35.65 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  36.41 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  39.56 
 
 
235 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  39.89 
 
 
233 aa  101  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  36.81 
 
 
203 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  37.85 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  34.29 
 
 
202 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  34.86 
 
 
202 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  34.86 
 
 
202 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  32.93 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  36.16 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  31.6 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  37.93 
 
 
213 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  33.53 
 
 
265 aa  85.1  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  37.35 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  34.16 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  37.13 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  33.16 
 
 
243 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  33.54 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  32.3 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  35.26 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  35.67 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  35.67 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  34.12 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  34.12 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  35.15 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  34.57 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  34.57 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  34.12 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  34.97 
 
 
206 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  34.64 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  30.9 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  32.32 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  35.12 
 
 
215 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  30.65 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  30.65 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  29.28 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  36.14 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  30.22 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  30.43 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  31.25 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  35.58 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  35.58 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  35.58 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  29.19 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  30.54 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  32.3 
 
 
207 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  33.14 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  33.71 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  32.53 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  29.59 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  29.41 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  32.1 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  30.3 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  29.81 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  31.68 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  31.06 
 
 
208 aa  67  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  28.4 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  27.17 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  28.28 
 
 
197 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  28.28 
 
 
197 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  28.4 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  27.49 
 
 
226 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  32.93 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  28.48 
 
 
370 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  26.77 
 
 
197 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  27.95 
 
 
253 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  26.09 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  26.22 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  25.75 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  34 
 
 
227 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  28.1 
 
 
179 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  27.67 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  26.16 
 
 
210 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  38.18 
 
 
134 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  28.03 
 
 
179 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  44.62 
 
 
192 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  36.96 
 
 
192 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>