157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0736 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  61.54 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  42.29 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  43.5 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  40.51 
 
 		 191 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  40 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  39.15 
 
 		 199 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  42.35 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  40.57 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  40 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  36.24 
 
 		 217 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  36.79 
 
 		 222 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  38.19 
 
 		 208 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  36.68 
 
 		 223 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  35.23 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  36.02 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  39.55 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  39.9 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  36.12 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  37.98 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  39.39 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  38.66 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  36.65 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  30.53 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  31.55 
 
 		 202 aa  90.1  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  36.41 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  35.26 
 
 		 229 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  32.84 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  36.51 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  36.51 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  32.43 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  31.98 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  31.72 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  32.98 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  34.74 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  31.94 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  33.68 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  28.64 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  31.55 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  31.55 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  35.08 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  31.91 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  35.08 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  29.23 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  31.18 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  35.08 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  33.68 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  32.12 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  32.12 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  29.41 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  32.43 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  31.75 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  30.93 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  27.04 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  32.64 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  33.51 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  30.73 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  33.85 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  29.85 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  29.79 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  29.79 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  29.79 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  31.72 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  30.16 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  30.21 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  30.35 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  30.11 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  30.57 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  29.23 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  30.48 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  29.29 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  29.84 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  29.32 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  26.77 
 
 		 224 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  29.17 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  28.27 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  28.27 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  28.27 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  28.27 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  27.98 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  28.8 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  26.2 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  27.03 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  23.81 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  27.89 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  26.67 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  22.99 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  22.65 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  28.72 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  21.93 
 
 		 179 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  27.51 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  30.69 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  42.37 
 
 		 126 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  39.06 
 
 		 122 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  25.26 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  37.93 
 
 		 119 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  39.06 
 
 		 113 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  37.93 
 
 		 120 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  39.39 
 
 		 134 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>