177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1517 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  532  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  47.66 
 
 
246 aa  216  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  44.27 
 
 
279 aa  207  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  45.02 
 
 
250 aa  207  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  64.47 
 
 
120 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  63.64 
 
 
116 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  37.33 
 
 
224 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  48.81 
 
 
147 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  35.12 
 
 
202 aa  89  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  34.15 
 
 
192 aa  88.6  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  36.18 
 
 
208 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  34.52 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  35.8 
 
 
202 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  32.28 
 
 
198 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  85.9  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45 
 
 
517 aa  85.9  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  38.22 
 
 
203 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  34.86 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  45.88 
 
 
126 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  57.14 
 
 
119 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  33.7 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  34.55 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  33.91 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  34.38 
 
 
207 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  55.71 
 
 
119 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  33.9 
 
 
231 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  35.95 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  34.46 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  28.52 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  32.24 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  30.95 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  45.74 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  32.7 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  45.57 
 
 
134 aa  79  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  32.89 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  33.74 
 
 
213 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  29.55 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  33.73 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  47.37 
 
 
122 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  33.73 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  30.97 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  36 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  37.16 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  34.13 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  30.18 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  28.4 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  33.88 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  40.66 
 
 
134 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  45 
 
 
128 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  49.33 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  35.33 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
217 aa  72  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 
139 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  35.76 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  35.76 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  35.76 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  42.53 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  41.49 
 
 
113 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  30 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  31.17 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  31.17 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  40.59 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  55.17 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  32.7 
 
 
191 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  30.3 
 
 
197 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  36.25 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  46.67 
 
 
130 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  40.45 
 
 
128 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  31.29 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  47.14 
 
 
127 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  48.48 
 
 
127 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  48.48 
 
 
127 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 
134 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  47.14 
 
 
130 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  37.86 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  26.82 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  47.14 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  43.21 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  43.21 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  30.2 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  32.87 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  30.52 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  33.64 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  32.28 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  30.72 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  27.39 
 
 
218 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  32.67 
 
 
209 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  26.06 
 
 
205 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  33.11 
 
 
212 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  49.38 
 
 
142 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  37.78 
 
 
131 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  40.26 
 
 
128 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  29.41 
 
 
203 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  29.17 
 
 
202 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  29.17 
 
 
202 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  29.81 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  31.37 
 
 
223 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>