162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1508 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  440  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  47.09 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  34.34 
 
 		 194 aa  99  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  31.88 
 
 		 197 aa  91.7  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  34.86 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  28.18 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  33.53 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  32.89 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  34.57 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  32.12 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  35.48 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  29.75 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  29.59 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  34.42 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  24.17 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  29.5 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  30.67 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6516  protein of unknown function DUF305  26.45 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  52.94 
 
 		 98 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  33.04 
 
 		 141 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  29.94 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  51.79 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  47.37 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  51.47 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  29.75 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  49.12 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  34.44 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  48.21 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  29.03 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  51.79 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  34.95 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  40.23 
 
 		 132 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  28.85 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  31.54 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  41.84 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  40.28 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  34.92 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  42.37 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  30.81 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  40.28 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  29.14 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  26.85 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  27.31 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  33.71 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  50.88 
 
 		 142 aa  62  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  27.19 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  42.19 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  48.33 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  44.83 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  27.84 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  33.77 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  33.77 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  33.77 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  43.66 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  33.7 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  33.7 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  38.81 
 
 		 130 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  32.9 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  33.55 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  32.9 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  30.67 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  39.34 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  38.82 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  38.24 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  38.24 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  39.53 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  42.11 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  49.12 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  32.26 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  29.11 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  45.61 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  37.1 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  40.85 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  35.87 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  28.05 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  30.59 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  39.66 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  43.06 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  37.66 
 
 		 151 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  27.93 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  26.29 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  49.02 
 
 		 152 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  31.85 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  42.11 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  27.7 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  29.63 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  29.63 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  41.1 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  28.66 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  27.21 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  26.61 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  31.94 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  33.87 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  30.3 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2645  hypothetical protein  28.21 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  31.06 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>