175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3889 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  72.81 
 
 
229 aa  280  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  67.54 
 
 
228 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  67.54 
 
 
228 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  70.7 
 
 
215 aa  251  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  69.13 
 
 
231 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  67.7 
 
 
227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  51.79 
 
 
243 aa  215  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  51.04 
 
 
237 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  51.04 
 
 
237 aa  198  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  61.22 
 
 
189 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  54.15 
 
 
218 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  49.57 
 
 
225 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  49.57 
 
 
225 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  48.29 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  44.84 
 
 
207 aa  174  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  45.29 
 
 
213 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  47.22 
 
 
203 aa  171  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  48.77 
 
 
217 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  43.78 
 
 
220 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  44.68 
 
 
232 aa  165  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  47.43 
 
 
209 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  46.38 
 
 
206 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  48.77 
 
 
217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  44.13 
 
 
213 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  44.13 
 
 
213 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  44.13 
 
 
213 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  49.71 
 
 
227 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  42.53 
 
 
197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  42.53 
 
 
197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  49.2 
 
 
237 aa  141  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  44.74 
 
 
199 aa  141  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  42.08 
 
 
197 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  44.16 
 
 
219 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  40.09 
 
 
213 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  44.09 
 
 
265 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  38.91 
 
 
202 aa  124  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  37.5 
 
 
208 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  39.55 
 
 
205 aa  119  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  41.03 
 
 
202 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  36.27 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  38.83 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  38.31 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  38.31 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  37.81 
 
 
202 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  38.16 
 
 
210 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  31.68 
 
 
205 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  34.86 
 
 
224 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  36.42 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  31.98 
 
 
223 aa  98.6  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  32.29 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  31.6 
 
 
188 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  31.6 
 
 
188 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  39.57 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  34.72 
 
 
232 aa  95.5  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  31.36 
 
 
207 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  35.85 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  32.17 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3708  hypothetical protein  32.07 
 
 
212 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  35.39 
 
 
223 aa  91.7  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  35.43 
 
 
264 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  33.53 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2814  hypothetical protein  31.9 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  34.98 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  38.18 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  30.63 
 
 
198 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  33.91 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  35.98 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  31.25 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  31.14 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  31.77 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  35.15 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  29.81 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  35.71 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  33.17 
 
 
188 aa  79  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  33.53 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  36.26 
 
 
243 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  36.71 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10390  hypothetical protein  29.65 
 
 
356 aa  77  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  35.48 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  31.75 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  32.73 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  33.93 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  31.34 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  32.74 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  30.99 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  30.9 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  32.74 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  30.81 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  29.41 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  32.2 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  27.23 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  32.74 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  28.24 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  32.34 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  32.65 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  29.24 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23400  hypothetical protein  39.73 
 
 
74 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549053  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  28.51 
 
 
226 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>