142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3974 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  60.85 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  41.77 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  41.46 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  37.62 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  37.61 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  35.62 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  41.63 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  38.7 
 
 		 217 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  35.47 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  38.92 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  38.79 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  37.04 
 
 		 300 aa  118  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  36.95 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  37.07 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  37.13 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  40.4 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  34.83 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  34.33 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  38.39 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  34.52 
 
 		 199 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  38.46 
 
 		 235 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  30.77 
 
 		 208 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  33.46 
 
 		 243 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  31.63 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  35.4 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  30.3 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  28.5 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  29.6 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  30.37 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  27.62 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  26.42 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  30.21 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  32.11 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  32.11 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  29.05 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  30.41 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  30.21 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  30.21 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  28.5 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  31 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  30.73 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  33.16 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  31.47 
 
 		 213 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  27.46 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  33.16 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  32.11 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  28.87 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  28.43 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  28.43 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  28.43 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  30.1 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  27.19 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  26.87 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  26.87 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  26.97 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  26.75 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  30.53 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  26.75 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  30.37 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  27.32 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  26.84 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  27.8 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  30.15 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  27.32 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  27.75 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  29.02 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  25.45 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  28.14 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  27.18 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  24.75 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  26.96 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  24.23 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  40.62 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  43.86 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  25.79 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  39.06 
 
 		 113 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  26.32 
 
 		 202 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  22.84 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  39.34 
 
 		 119 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  25.91 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  41.07 
 
 		 134 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  39.34 
 
 		 119 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  36.67 
 
 		 134 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  20.3 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  39.66 
 
 		 120 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  24.88 
 
 		 192 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1820  hypothetical protein  29.63 
 
 		 415 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.241651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  39.34 
 
 		 125 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  37.93 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  35.94 
 
 		 130 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  32.84 
 
 		 127 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  25.76 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>