142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1820 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1820  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  789    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.241651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  74.26 
 
 
407 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  68.73 
 
 
370 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  41.89 
 
 
224 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  39.75 
 
 
208 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  37.93 
 
 
208 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  39.33 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  30.86 
 
 
191 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  32.75 
 
 
205 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  33.8 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  34.51 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  35.12 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  37.42 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  33.11 
 
 
212 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  33.1 
 
 
195 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  32.8 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  32.93 
 
 
243 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  28.75 
 
 
221 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  30 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  29.38 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  28.11 
 
 
270 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  34.23 
 
 
202 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  28.12 
 
 
222 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  33.11 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  35.62 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  34.01 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  30.16 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  35.62 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  35.62 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  30.16 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  29.76 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  33.16 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  30.46 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  30.81 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  32.26 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  28.67 
 
 
207 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  29.63 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  37.32 
 
 
202 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  32.88 
 
 
279 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  29.41 
 
 
207 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  29.33 
 
 
226 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  29.19 
 
 
264 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  26.71 
 
 
265 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  35.17 
 
 
198 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  31.69 
 
 
250 aa  63.2  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  30.14 
 
 
179 aa  63.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  32.43 
 
 
246 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  27.96 
 
 
232 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  29.09 
 
 
239 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  34.93 
 
 
203 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  28.95 
 
 
209 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  30.99 
 
 
223 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  34.48 
 
 
203 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  27.4 
 
 
179 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  32.41 
 
 
263 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  29.25 
 
 
199 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  29.08 
 
 
253 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  30.53 
 
 
229 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  37.24 
 
 
227 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  29.37 
 
 
188 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  27.21 
 
 
200 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  31.93 
 
 
220 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  30.29 
 
 
257 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  29.48 
 
 
237 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  31.85 
 
 
189 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  31.65 
 
 
223 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  29.55 
 
 
280 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  28.17 
 
 
211 aa  56.6  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  29.55 
 
 
192 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  35.61 
 
 
206 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  32.47 
 
 
213 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  31.47 
 
 
207 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  25.87 
 
 
213 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  25.87 
 
 
213 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  25.87 
 
 
213 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1648  hypothetical protein  30.95 
 
 
191 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174345  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  35.37 
 
 
207 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  27.15 
 
 
253 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  30.77 
 
 
231 aa  53.9  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  28.37 
 
 
210 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  26.32 
 
 
235 aa  53.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  24.43 
 
 
300 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  50.94 
 
 
116 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  24.29 
 
 
248 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7907  hypothetical protein  30.87 
 
 
202 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  26.82 
 
 
226 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  27.86 
 
 
241 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  25.97 
 
 
218 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  29.17 
 
 
227 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  27.54 
 
 
228 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  27.54 
 
 
228 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  24.68 
 
 
206 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  32.93 
 
 
143 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  27.52 
 
 
227 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  28.1 
 
 
192 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  28.87 
 
 
197 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  24.66 
 
 
194 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  41.82 
 
 
134 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>