191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4123 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  63.35 
 
 		 202 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  48.48 
 
 		 224 aa  148  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  42.16 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  38.62 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  46.71 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  38.37 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  36.57 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  35.03 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  38.41 
 
 		 218 aa  104  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  38.46 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  43.79 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  36.73 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  35.62 
 
 		 211 aa  95.5  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  35.15 
 
 		 265 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  37.84 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  34.87 
 
 		 208 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  36.9 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  35.29 
 
 		 241 aa  87.8  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  37.67 
 
 		 246 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  35.08 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  32.28 
 
 		 263 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  35.37 
 
 		 279 aa  85.5  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  38.56 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  34.59 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  34.59 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  34.59 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  31.1 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  38.79 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  37.33 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  35.33 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  33.15 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  36.69 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  35.48 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  37.58 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  31.91 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2645  hypothetical protein  32.95 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  29.45 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  32.98 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  34.8 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  32.2 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  28.64 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  31.48 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  35.21 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  33.09 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  29.88 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  32.22 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  33.57 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  35.21 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  35.21 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  29.59 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  33.75 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  33.75 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  32.11 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  32.26 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  34 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2533  hypothetical protein  28.06 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0056757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  34.51 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  35.37 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  32.67 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  29.73 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  30.98 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  32.32 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  30.5 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  29.12 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  36.84 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  28.07 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  28.07 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  32.16 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  29.81 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  31.84 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  28.65 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  31.78 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  29.53 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  38.78 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  27.03 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  29.24 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  53.33 
 
 		 120 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  41.78 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  27.48 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  55.77 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  27.48 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  29.89 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  30.64 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  31.25 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  41.57 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  34.51 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  54.55 
 
 		 119 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  29.48 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  53.7 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  29.48 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  27.88 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  28.65 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  28.9 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  30.11 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>