21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2533 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2533  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0056757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  35.54 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  30.36 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  29.81 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  28.06 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  24.69 
 
 
224 aa  61.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  27.92 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  29.08 
 
 
241 aa  58.2  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  27.06 
 
 
218 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  21.38 
 
 
253 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  26.53 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  26.85 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  28.47 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  33.33 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2645  hypothetical protein  27.86 
 
 
207 aa  45.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  25.17 
 
 
192 aa  44.7  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  23.65 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  26.72 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  45.83 
 
 
148 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>