196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2783 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  407  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  63.35 
 
 
198 aa  247  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  42.4 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  43 
 
 
224 aa  147  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  39.15 
 
 
188 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  40.57 
 
 
211 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  42.5 
 
 
218 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  34.01 
 
 
200 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  38 
 
 
192 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  38.42 
 
 
279 aa  99  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  37.86 
 
 
210 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  40.83 
 
 
246 aa  97.8  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  36.16 
 
 
263 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  36.6 
 
 
192 aa  95.5  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  37.97 
 
 
253 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  41.18 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  39.18 
 
 
250 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  35.15 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  37.58 
 
 
265 aa  89.4  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  34.48 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  33.16 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  42.66 
 
 
230 aa  84.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  36.88 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  33.51 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  27.56 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  33.51 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  32.45 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  32.45 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  33.57 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  33.67 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  28.78 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  29.41 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  37.01 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  29.28 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  35.03 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2533  hypothetical protein  31.03 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0056757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  39.04 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  35.05 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  35.05 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  29.68 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  35.75 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2645  hypothetical protein  37.28 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  34.85 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  39.09 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  34.44 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  32.96 
 
 
219 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  35.44 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  29.7 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  51.39 
 
 
120 aa  72  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  29.89 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  32.37 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  33.85 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  32.54 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  29.84 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  27.45 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  30.87 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  30.46 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  56.36 
 
 
119 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  31.36 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  31.54 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  51.56 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  30.77 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  32.19 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  32.19 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  32.19 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  57.41 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  51.39 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  55.56 
 
 
132 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  32.03 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  29.53 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  56.6 
 
 
113 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  36.17 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  34.72 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  34.72 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  27.68 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  36.11 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  41.03 
 
 
152 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  54.72 
 
 
134 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  55.56 
 
 
128 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  30.36 
 
 
229 aa  62  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  43.53 
 
 
117 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  28.5 
 
 
218 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  30.43 
 
 
189 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  55.56 
 
 
128 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  29.33 
 
 
213 aa  61.6  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  30.41 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  29.27 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  27.88 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  25.17 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  30.41 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  32.37 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  28.48 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  31.82 
 
 
137 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  52.73 
 
 
134 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  53.7 
 
 
128 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  27.36 
 
 
237 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  52.83 
 
 
126 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7907  hypothetical protein  26.94 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>