180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4487 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  420  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  62.2 
 
 
207 aa  235  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  58.69 
 
 
213 aa  211  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  58.69 
 
 
213 aa  211  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  58.69 
 
 
213 aa  211  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  56.68 
 
 
206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  41.3 
 
 
237 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  41.3 
 
 
237 aa  165  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  40.32 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  48.59 
 
 
228 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  48.59 
 
 
228 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  47.67 
 
 
227 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  44.5 
 
 
203 aa  158  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  42.99 
 
 
213 aa  157  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  49.71 
 
 
218 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  41.07 
 
 
220 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  48.8 
 
 
227 aa  155  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  45.51 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  45.51 
 
 
189 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  45.21 
 
 
217 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  46.86 
 
 
215 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  38.66 
 
 
225 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  38.66 
 
 
225 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  45.66 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  48.19 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  46.55 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  39.24 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  42.15 
 
 
237 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  43.81 
 
 
219 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  49.38 
 
 
199 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  45.35 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  40 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  46.88 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  42.29 
 
 
202 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  45.16 
 
 
202 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  45.16 
 
 
202 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  44.52 
 
 
202 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  45.91 
 
 
210 aa  124  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  40.46 
 
 
208 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  44.38 
 
 
205 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  39.07 
 
 
213 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  41.95 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  40.78 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  40.23 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  36.9 
 
 
197 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  40.85 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  40.85 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  38.61 
 
 
207 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  40.24 
 
 
197 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  43.05 
 
 
207 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  42.28 
 
 
212 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  37.23 
 
 
223 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  37.87 
 
 
223 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  32.32 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  32.88 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  41.29 
 
 
227 aa  92  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  37.25 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  33.77 
 
 
208 aa  84.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  34.64 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3708  hypothetical protein  30.19 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  30.19 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  30.19 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23400  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  81.3  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549053  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  31.76 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  31.22 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  33.74 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  30.46 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  34.25 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  30.5 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  33.15 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  33.55 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  35.95 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  29.17 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  33.7 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  29.31 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  30.96 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  34.75 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  29.27 
 
 
206 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  33.75 
 
 
230 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  29.41 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  31.91 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  33.76 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  30.77 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2814  hypothetical protein  27.95 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10390  hypothetical protein  26.09 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206223  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  33.51 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  28.18 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  34.34 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  32.28 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  33.75 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  32.92 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  29.19 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  29.75 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  32 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  26.21 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  32.67 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  27.51 
 
 
264 aa  65.1  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  32.21 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  31.03 
 
 
280 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  27.33 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>