139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4575 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  44.74 
 
 
208 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  46.88 
 
 
257 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  45.13 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  42.79 
 
 
280 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  41.74 
 
 
217 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  39.92 
 
 
229 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  39.08 
 
 
248 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  39.81 
 
 
271 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  39.19 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  39.47 
 
 
191 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  38.71 
 
 
223 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  36.75 
 
 
217 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  40.7 
 
 
270 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  40.1 
 
 
253 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  38.54 
 
 
264 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  37.32 
 
 
270 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  37.23 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  37.23 
 
 
243 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  35.5 
 
 
235 aa  99.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  38.54 
 
 
214 aa  99  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  37.11 
 
 
243 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  36.77 
 
 
233 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  37.24 
 
 
229 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  32.24 
 
 
265 aa  96.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  31.35 
 
 
222 aa  95.9  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  36.67 
 
 
231 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  34.64 
 
 
202 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  35.2 
 
 
202 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  35.2 
 
 
202 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  30.81 
 
 
221 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  34.85 
 
 
228 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  34.85 
 
 
228 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  35.68 
 
 
189 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  36.67 
 
 
215 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  32.49 
 
 
219 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  31.28 
 
 
208 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
203 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  36.02 
 
 
237 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  32.78 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  38.31 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  36.26 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  31.32 
 
 
202 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  31.86 
 
 
197 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  31.86 
 
 
197 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  30.73 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  33.52 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  30.73 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  32.78 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  33.67 
 
 
227 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  31.43 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  31.35 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  31.87 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  31.51 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  32.78 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  35.53 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  31.38 
 
 
209 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  35.53 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  31.11 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  29.28 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  26.92 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  30.77 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  32.64 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  32.64 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  31.98 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  29.28 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  29.63 
 
 
197 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  33.92 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  30.61 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  29.28 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  29.28 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  29.28 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  30.77 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  27.84 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  30.22 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  31.67 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  30.97 
 
 
197 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  29.65 
 
 
206 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  28.02 
 
 
223 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  30 
 
 
208 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  27.32 
 
 
192 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  27.68 
 
 
263 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  27.07 
 
 
206 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  27.47 
 
 
198 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  27.57 
 
 
232 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  24.35 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  26.49 
 
 
226 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  29.61 
 
 
279 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  24.59 
 
 
226 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3708  hypothetical protein  25.22 
 
 
212 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  26.02 
 
 
188 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  26.02 
 
 
188 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2814  hypothetical protein  27.07 
 
 
188 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  26.92 
 
 
218 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  47.46 
 
 
211 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  24.44 
 
 
192 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  28.33 
 
 
230 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  27.98 
 
 
202 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  39.47 
 
 
139 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  27.27 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>