102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3506 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 235 aa  467  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  36.36 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  39.07 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  36.75 
 
 		 217 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  35.54 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  34.65 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  38.5 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  31.64 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  36.06 
 
 		 280 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  35.2 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  37.98 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  34.05 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  34.12 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  36.92 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  37.57 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  33.91 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  34.62 
 
 		 265 aa  92.8  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  34.3 
 
 		 270 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  32.98 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  30.18 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  33.5 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  34.63 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  32.97 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  32.77 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  31.47 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  28.25 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  32.95 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  32.12 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  34.44 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  31.94 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  30.28 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  29.19 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  31.79 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  32.6 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  32.6 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  30.94 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  31.34 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  30.23 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  35.36 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  32.16 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  32.78 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  31.11 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  31.11 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  33.85 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  30.77 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  34.41 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  32.97 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  31.44 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  31.44 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  31.18 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  31.02 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  32.65 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  27.59 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  27.59 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  32.63 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  30.93 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  30.93 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  31.46 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  30 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  29.48 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  31.4 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  29.82 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  30.94 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  26.73 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  29.71 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  29.71 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  29.71 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  27.84 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  28.04 
 
 		 232 aa  62  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  29.15 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  28.02 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  27.65 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  29.96 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  30.41 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  28.72 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  26.7 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  28.08 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  21.78 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  26.87 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  22.28 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  24.2 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  24.72 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  25.54 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  25 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  34.72 
 
 		 407 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10390  hypothetical protein  27.42 
 
 		 356 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206223  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  27.66 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  27.66 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2814  hypothetical protein  25 
 
 		 188 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  27.65 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  28.12 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  40.74 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  25.33 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  36.21 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3708  hypothetical protein  27.65 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  25.3 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  25.49 
 
 		 192 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>