153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2254 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  440  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  79.37 
 
 
223 aa  341  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  42.55 
 
 
212 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  37.61 
 
 
237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  41.24 
 
 
208 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  38.96 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  33.98 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  37.9 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  42.38 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  42.94 
 
 
202 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  42.14 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  37.65 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  41.57 
 
 
227 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  35.12 
 
 
232 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  33.7 
 
 
206 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  37.91 
 
 
202 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  38.41 
 
 
207 aa  101  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  36.02 
 
 
209 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  36.16 
 
 
237 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  42.28 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  36.84 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  33.9 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  36.88 
 
 
202 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  41.03 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  36 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  36.25 
 
 
202 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  36.25 
 
 
202 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  35.23 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  34.46 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  36.93 
 
 
215 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  34.84 
 
 
210 aa  92  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  42.11 
 
 
227 aa  91.7  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  38.22 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  35.26 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  32.8 
 
 
219 aa  89  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  35.43 
 
 
227 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  31.94 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  31.94 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  31.72 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  31.72 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  37.41 
 
 
197 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  37.41 
 
 
197 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  35.44 
 
 
217 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  30.61 
 
 
243 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  37.04 
 
 
189 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  35.29 
 
 
213 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  34.25 
 
 
228 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  34.25 
 
 
228 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  32.22 
 
 
227 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  33.14 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  35.44 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  34.23 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  34.23 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  34.23 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  27.88 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  32.53 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  33.55 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  31.71 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  33.77 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  32.93 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  35.37 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  30.43 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  32.3 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  28.29 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  26.74 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  34.19 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  31.18 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  30.32 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  29.27 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  31.29 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  31.9 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  27.62 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  33.12 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  28.14 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3397  hypothetical protein  33.58 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  28.3 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  28.8 
 
 
300 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  27.44 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  34.03 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  28.57 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  26.88 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  27.78 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  34.62 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  26.67 
 
 
264 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  28.97 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  27.61 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  29.37 
 
 
200 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
230 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  29.25 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  27.27 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  29.07 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  26.01 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  31.08 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  24.24 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  34.17 
 
 
134 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  31.61 
 
 
188 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  25.27 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  24.62 
 
 
271 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  25.71 
 
 
250 aa  55.5  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>