58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0010 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 173 aa  352  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  60.26 
 
 		 278 aa  187  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  60.26 
 
 		 278 aa  187  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  59.21 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  58.06 
 
 		 297 aa  183  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  61.81 
 
 		 148 aa  182  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  56.58 
 
 		 158 aa  180  8.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  57.89 
 
 		 161 aa  180  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  53.09 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  50.33 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  56.25 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  51.97 
 
 		 170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  46.95 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  49.01 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  63.21 
 
 		 137 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  45.52 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  43.79 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  51.33 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  48.18 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  37.59 
 
 		 147 aa  97.8  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  36.49 
 
 		 170 aa  91.3  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  36.73 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  32.03 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  35.06 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  34.59 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  33.12 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  34.38 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  33.78 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  34.04 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  32.89 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  48.21 
 
 		 134 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  48.21 
 
 		 113 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  46.43 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  45 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  44.44 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  44.23 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  49.02 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 223 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  39.06 
 
 		 213 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  39.62 
 
 		 200 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  36.07 
 
 		 128 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  38.18 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  45.28 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  36.36 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  36.51 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2533  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0056757  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  46.3 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  44.07 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  42.59 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  38.81 
 
 		 230 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.18 
 
 		 517 aa  41.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  36.07 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  35.71 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  34.55 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  35.71 
 
 		 217 aa  40.8  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  35.71 
 
 		 217 aa  40.8  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  36.36 
 
 		 128 aa  40.8  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>