46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3896 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  344  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  76.22 
 
 		 167 aa  263  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  73.94 
 
 		 166 aa  248  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  79.33 
 
 		 151 aa  245  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  63.23 
 
 		 161 aa  203  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  64.94 
 
 		 171 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  54.61 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  53.08 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  38.04 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  35.03 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  36 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  33.56 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  38.85 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  37.76 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  33.54 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  33.76 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  34.38 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  32.89 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  30.13 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  28.29 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  28.29 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  43.56 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  34.31 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  33.1 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  33.1 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  31.45 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  30.66 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  36.61 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  31.03 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  31.62 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  41.51 
 
 		 226 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  48.21 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  48.15 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  43.33 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  42.37 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  48 
 
 		 128 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  41.18 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  42.86 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  41.07 
 
 		 131 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  46 
 
 		 128 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  41.38 
 
 		 206 aa  41.6  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  40.68 
 
 		 132 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  41.51 
 
 		 188 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  43.75 
 
 		 192 aa  41.2  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  41.82 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  37.31 
 
 		 217 aa  40.8  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>