31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0287 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  100 
 
 
201 aa  420  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  72.99 
 
 
178 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  52.8 
 
 
278 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  52.8 
 
 
278 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  51.83 
 
 
170 aa  164  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  51.75 
 
 
158 aa  150  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  49.65 
 
 
161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  46.54 
 
 
161 aa  144  9e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  49.31 
 
 
297 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  51.75 
 
 
148 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  46.95 
 
 
173 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  51.97 
 
 
137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  42.77 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  47.22 
 
 
163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  42.25 
 
 
161 aa  119  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  37.13 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  39.6 
 
 
157 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  37.86 
 
 
161 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  35.8 
 
 
166 aa  91.3  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  35.19 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  38.69 
 
 
151 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  36.77 
 
 
161 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  38.69 
 
 
167 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  37.76 
 
 
167 aa  85.9  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  44.55 
 
 
118 aa  82  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  36.09 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  33.09 
 
 
164 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  32.12 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  30.71 
 
 
147 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  38.1 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>