97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2420 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  299  9e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  52.82 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  52.82 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  55.38 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  55.17 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  53.08 
 
 		 167 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  46.48 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  48.59 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  44.37 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  41.55 
 
 		 175 aa  120  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  41.43 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  41.35 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  39.26 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  36.99 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  40.85 
 
 		 170 aa  106  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  37.59 
 
 		 173 aa  97.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  35.86 
 
 		 297 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  36.55 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  38.57 
 
 		 170 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  42.72 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  32.58 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  34.72 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  32.58 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  31.76 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  30.41 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  36.11 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  31.08 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  35.78 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  36.09 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  33.59 
 
 		 210 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  34.21 
 
 		 119 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  30.7 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  48.33 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  48.21 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  48.33 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  45.16 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  49.06 
 
 		 202 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  38.32 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  48.21 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  46.43 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  45.16 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  50.91 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  43.55 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  43.55 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  44.44 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  49.09 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  47.27 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  48.21 
 
 		 246 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  32.61 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  32.61 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  32.61 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  43.14 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  31.36 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  51.85 
 
 		 198 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  40.98 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.64 
 
 		 517 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  38.89 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  45.28 
 
 		 211 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  43.64 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  48.21 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  45.45 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  43.33 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  48.15 
 
 		 192 aa  43.9  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 		 230 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  46.43 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  45.45 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  30.85 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  41.51 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  41.18 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  36.17 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  37.5 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  32.58 
 
 		 407 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  35.48 
 
 		 206 aa  42  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  45.45 
 
 		 279 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  41.79 
 
 		 206 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  40.74 
 
 		 200 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  43.64 
 
 		 208 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  41.51 
 
 		 270 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 399 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  40.35 
 
 		 263 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  31.87 
 
 		 223 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  37.1 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  39.34 
 
 		 228 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  41.07 
 
 		 241 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  35.82 
 
 		 232 aa  40.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  39.34 
 
 		 228 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  47.06 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  35.21 
 
 		 209 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  43.4 
 
 		 202 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  25.47 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  45.45 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  46 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  45.45 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  46 
 
 		 152 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  43.33 
 
 		 91 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  44.23 
 
 		 253 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>