39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1942 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  351  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  62.18 
 
 		 278 aa  197  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  62.18 
 
 		 278 aa  197  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  60.96 
 
 		 297 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  62.31 
 
 		 137 aa  184  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  51.83 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  51.97 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  53.42 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  54.79 
 
 		 158 aa  166  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  52.74 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  46.67 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  53.42 
 
 		 148 aa  158  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  51.8 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  45.52 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  45.77 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  39.41 
 
 		 185 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  42.38 
 
 		 210 aa  124  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  38.93 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  38.57 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  38.03 
 
 		 147 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  41.67 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  41.44 
 
 		 118 aa  84.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  33.58 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  30.66 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  31.97 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  31.03 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  31.97 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  32.85 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  31.16 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  31.16 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  39.66 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  45.76 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 		 119 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  42.37 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  43.64 
 
 		 119 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  34.62 
 
 		 210 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.33 
 
 		 517 aa  41.2  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 		 200 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>