80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11363 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  329  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  72.22 
 
 
163 aa  249  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  52.94 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  52.23 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  50.33 
 
 
173 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  54.11 
 
 
148 aa  157  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  50.98 
 
 
161 aa  154  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  54.23 
 
 
278 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  54.23 
 
 
278 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  52.11 
 
 
297 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  46.98 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  46.91 
 
 
161 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  45.33 
 
 
178 aa  138  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  45.52 
 
 
170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  42.25 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  39.26 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  39.24 
 
 
175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  38.46 
 
 
171 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  40.85 
 
 
210 aa  100  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  39.33 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  39.19 
 
 
164 aa  99  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  34.42 
 
 
185 aa  97.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  51.55 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  33.54 
 
 
167 aa  84  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  36.62 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  33.58 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  31.03 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  31.03 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  28.3 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  54.55 
 
 
117 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  47.54 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  45 
 
 
128 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  46.55 
 
 
128 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  45.76 
 
 
134 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  47.27 
 
 
132 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  43.33 
 
 
128 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  50.98 
 
 
116 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  43.14 
 
 
211 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  46.43 
 
 
119 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  43.64 
 
 
120 aa  47.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  38.98 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  46.3 
 
 
226 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  49.09 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  40.66 
 
 
131 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  38.18 
 
 
223 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  40.35 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.5 
 
 
517 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  48.21 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  41.82 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  48.15 
 
 
132 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  48.08 
 
 
227 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  42.59 
 
 
202 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  41.07 
 
 
192 aa  44.3  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  41.51 
 
 
206 aa  44.3  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  42.59 
 
 
202 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  43.4 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  37.88 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  43.64 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  39.29 
 
 
202 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  42.86 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  42.31 
 
 
206 aa  42.4  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  54.35 
 
 
131 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  54.35 
 
 
137 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  37.31 
 
 
205 aa  42  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 
224 aa  42  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  46.81 
 
 
239 aa  41.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  40 
 
 
246 aa  41.6  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  44.9 
 
 
202 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  43.86 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  40.62 
 
 
198 aa  41.2  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  41.07 
 
 
217 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  45.1 
 
 
231 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  44.64 
 
 
143 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  47.06 
 
 
215 aa  40.8  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  34.38 
 
 
122 aa  40.8  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  44.64 
 
 
229 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  34.21 
 
 
197 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  44.9 
 
 
152 aa  40.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>