118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1099 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  100 
 
 
160 aa  322  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  45.76 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  48.1 
 
 
517 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  40.37 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  46.84 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  46.15 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  44.87 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  46.67 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  45.56 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  43.59 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  45.98 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  42.7 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  43.04 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  36.45 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  44.05 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2575  hypothetical protein  44.3 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0843755  normal  0.521427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  39.24 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  38.1 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  39.33 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  39.13 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  36.26 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  50.91 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  50 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1027  protein of unknown function DUF305  43.04 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2316  hypothetical protein  41.05 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.865879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  34.64 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  33.98 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  37.35 
 
 
279 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  41.03 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  41.89 
 
 
134 aa  60.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  37.5 
 
 
128 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  37.5 
 
 
128 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  38.55 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  36.14 
 
 
263 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  39.47 
 
 
246 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  47.27 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  38.55 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  41.67 
 
 
122 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  37.04 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  42.86 
 
 
202 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  42.86 
 
 
202 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  36.14 
 
 
250 aa  58.2  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  42.86 
 
 
202 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  38.2 
 
 
130 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  35.96 
 
 
127 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  36.49 
 
 
206 aa  58.2  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  38.96 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  37.65 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  41.33 
 
 
230 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  36.51 
 
 
128 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
209 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  36.47 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  36.47 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  41.27 
 
 
192 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  38.67 
 
 
192 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  37.68 
 
 
224 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  38.57 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  38.57 
 
 
141 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  38.89 
 
 
211 aa  54.3  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  38.57 
 
 
116 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  41.82 
 
 
217 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  38.57 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  37.88 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  35.14 
 
 
207 aa  51.2  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  38.98 
 
 
226 aa  51.2  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  35.37 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  35.37 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  38.89 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  27.71 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  27.63 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  39.39 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  32.5 
 
 
237 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  38.98 
 
 
161 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  39.34 
 
 
91 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  36.21 
 
 
218 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  41.07 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  30.43 
 
 
197 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  37.7 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  34.62 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  34.85 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  34.85 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  36.36 
 
 
223 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  28.46 
 
 
226 aa  45.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  38.6 
 
 
265 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  47.92 
 
 
195 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  34.85 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  34.48 
 
 
132 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  34.83 
 
 
213 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  34.83 
 
 
213 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  34.83 
 
 
213 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  37.29 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  32.05 
 
 
207 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  37.93 
 
 
231 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  30.1 
 
 
270 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  36.62 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  36.36 
 
 
217 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  36.36 
 
 
217 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  29.17 
 
 
205 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  40 
 
 
207 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>