52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2575 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2575  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  244  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0843755  normal  0.521427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1027  protein of unknown function DUF305  90.24 
 
 		 123 aa  223  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2316  hypothetical protein  36.57 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.865879 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.79 
 
 		 517 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  43.75 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  48.65 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  36.59 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  29.82 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  35.77 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  35.56 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  34.52 
 
 		 279 aa  53.9  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  32.8 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  43 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  41.11 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  41.11 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  30.34 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  44.26 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  36.21 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  35.29 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  36.36 
 
 		 250 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  35.9 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  32.73 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  30.56 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  35.63 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  24 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  31.4 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  37.25 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  34.19 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  36.99 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  35.09 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  36.49 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  27.59 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  40 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  27.78 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  35.38 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  30.12 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  37.1 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  35.23 
 
 		 134 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  31.18 
 
 		 127 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  32 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  25.6 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  41.79 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  32.26 
 
 		 192 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  30.51 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  38 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  31.58 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  31.58 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  32.81 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  32.81 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>