116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4933 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 158 aa  315  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 158 aa  315  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  71.05 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  60 
 
 		 164 aa  158  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  72.73 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  55.43 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  55.43 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  43.22 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  49 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  46.03 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  38.02 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  41.12 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  43.48 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  53.12 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  52.31 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  53.12 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  53.12 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  51.56 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  38.05 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  53.12 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  53.12 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  53.12 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  46.84 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  35.38 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  38.6 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  44.74 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  38.3 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  38.78 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  43.06 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  50.68 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  33.9 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  37.78 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  37.78 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  40.51 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  50.98 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  38.89 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  40.98 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  35.06 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  39.47 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  45.59 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  33.61 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  33.05 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  38.46 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  39.22 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.48 
 
 		 517 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  35.58 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  37.04 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  29.85 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  38.1 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  43.86 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  36.9 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  42.03 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  39.39 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  29.6 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  37.04 
 
 		 263 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  38.24 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  32.65 
 
 		 237 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  41.82 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  47.27 
 
 		 207 aa  51.6  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  37.8 
 
 		 209 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6516  protein of unknown function DUF305  31.67 
 
 		 218 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  45.1 
 
 		 224 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  42.19 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  44.23 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  39.22 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  39.22 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  36.11 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  38.67 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  41.82 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  34.12 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  39.13 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  35.48 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  38.6 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  39.44 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  39.58 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  43.14 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  43.55 
 
 		 370 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  33.82 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  29.21 
 
 		 271 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  38.98 
 
 		 239 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  36.67 
 
 		 270 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  34.85 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  46.81 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  46.3 
 
 		 206 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2281  protein of unknown function DUF305  32.88 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0018571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  37.5 
 
 		 223 aa  44.7  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  40.38 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  39.22 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  38 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  33.9 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  42.11 
 
 		 232 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  37.5 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  34.78 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  37.04 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  40.98 
 
 		 407 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  35.06 
 
 		 237 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>