156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5736 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  100 
 
 
132 aa  259  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  64.96 
 
 
150 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  66.29 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  66.29 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  47.58 
 
 
128 aa  100  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  53.77 
 
 
152 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  57.89 
 
 
164 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  49.58 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  50 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  51.28 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  56.25 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  57.14 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  56.94 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  56.94 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  56.72 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  51.16 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  53.62 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  45.56 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  45.56 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  39.06 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  39.47 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  45.26 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  45.26 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  40.37 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  51.35 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  54.41 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  50 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  38.76 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  60.38 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  45.45 
 
 
250 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  40.74 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  45.88 
 
 
246 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  56.45 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  48.61 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  56.45 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  56.45 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  37.93 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  46.79 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  36.67 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  50.67 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  50.79 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  44.32 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  48.48 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  40.23 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  50.79 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  37.7 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  35.96 
 
 
223 aa  63.5  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  35.78 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  38.3 
 
 
206 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  47.62 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  41.89 
 
 
263 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  50.72 
 
 
230 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  48.44 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  48.44 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  43.18 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  36.59 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  43.86 
 
 
209 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  54.55 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  35.9 
 
 
207 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  52.83 
 
 
206 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  45.45 
 
 
236 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.05 
 
 
517 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  44.83 
 
 
192 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  27.43 
 
 
200 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  50 
 
 
205 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  43.64 
 
 
234 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  48.28 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  38.67 
 
 
194 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  35.29 
 
 
210 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  47.17 
 
 
207 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  47.27 
 
 
219 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  43.4 
 
 
191 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  47.17 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  50.91 
 
 
175 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  47.17 
 
 
192 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  41.82 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  42.86 
 
 
265 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  43.64 
 
 
237 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  45.28 
 
 
208 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6516  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
218 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14254  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  41.82 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  48 
 
 
224 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  46.3 
 
 
237 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  45.45 
 
 
210 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  35.94 
 
 
208 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  38.46 
 
 
300 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  36.05 
 
 
197 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  41.67 
 
 
237 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  36.47 
 
 
239 aa  47  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2316  hypothetical protein  41.03 
 
 
130 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.865879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  44.26 
 
 
208 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  41.82 
 
 
225 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  41.82 
 
 
225 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  41.82 
 
 
227 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  39.29 
 
 
257 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  46.97 
 
 
199 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  44 
 
 
197 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  43.64 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>